故事的发生地是在一座名为星元市的小城市 　　在市内的狮子尾山上耸立着一个闪耀着彩色光芒的巨大物体这个被命名为“摩诺之角”的物体实际上是16年前“怪兽之日”事件发生之后就矗立在那里的“怪兽的角” 　　在世界各地同时出现怪兽的“怪兽之日”事件发生之后怪兽灾害开始变得日常日本的地球防卫队开始以武力对付怪兽的同时怪兽防灾科学调查所（统称SKIP Scientific Kaiju Investigation and Prevention center）也为了防止怪兽灾害的发生和受灾情况扩大不断对各地区进行科学调查和避难引导这个组织时至今日还在不停地调查“怪兽之日”出现的原因和城市中的“摩诺之角” 　　年仅7岁的“优马”在狮子尾山与父母露营时遭遇了怪兽袭击他奇迹般地生还并毫发无伤以此为契机“优马”踏上了研究怪兽生物学的道路虽然有着痛苦的过去...